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層析體系需要優化，緩沖體系的pH要在7.5-8.3之間，添加200-500mM氯化鈉減少非特異性吸附，上樣完后要徹底清洗，保證層析填料孔內，顆粒間未結合的蛋白全部洗出后，在開始洗脫，保證上完樣后，清洗在10CV以上。洗脫過程需要摸索咪唑的強度梯度，用連續咪唑梯度來摸索洗脫濃度。

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CHO細胞培養后先經過離心的方式去除細胞及細胞碎片，也可用微濾或者深層過濾的方式去除細胞及細胞碎片。去除細胞和細胞碎片后用rProtein A親和層析介質經親和層析捕獲，把單抗從培養液中快速的捕獲出來，此步驟可以去除大量的HCP，單抗去折疊片段，病毒及HCD和培養基組份物質。

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組氨酸（His）的殘基上帶有一個咪唑基團，可以和Ni2+,Co2+等過渡金屬離子形成配位鍵而選擇性的結合在金屬離子上，這些金屬離子能夠用螯合配體固定在層析介質上，因此帶有組氨酸標簽的蛋白在經過裝配了金屬離子的層析介質時可以選擇性的結合在介質上，而其他的雜質蛋白則不能結合或者僅能微弱結合。結合在介質上的HIS標簽蛋白可以通過提高緩沖液中的咪唑濃度進行競爭性洗脫，從而得到較高純度的HIS標簽蛋白。

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抗體純化親和層析介質：重組蛋白A可特異性與抗體的Fc區結合，用于單抗或多抗的分離純化，經過一步層析，就可從腹水，血清或培養液等樣品中得到高純度的抗體。重組蛋白G可用于分離純化細胞培養液或細胞提取物中不同屬抗體或抗體的Fc片段，多位點活化偶聯減少了配體的泄露，用于IgG單克隆抗體的實驗室規模和工業化大規模純化，能迅速處理大體積樣品。